Standardaminosyre

Proteinogene aminosyrer, også kendt som normale, primære eller standardaminosyrer, omfatter de 20 aminosyrer, der indgår i proteiner i levende celler, og som kan afkodes via den genetiske kode. Denne artikel lister detaljer for disse aminosyrer, hvad angår kemisk struktur og egenskaber.

Strukturer og symboler for de 20 aminosyrer, der direkte kodes for ved proteinsyntese af den genetiske kode. Strukturen af en aminosyre og dens funktionelle grupper har stor betydning for dens virkning i proteiner.

• 
  L-Alanin
  (Ala / A)
• 
  L-Arginin
  (Arg / R)
• 
  L-Asparagin
  (Asn / N)
• 
  L-Asparaginsyre
  (Asp / D)
• 
  L-Cystein
  (Cys / C)
• 
  L-Glutaminsyre
  (Glu / E)
• 
  L-Glutamin
  (Gln / Q)
• 
  Glycin
  (Gly / G)
• 
  L-Histidin
  (His / H)
• 
  L-Isoleucin
  (Ile / I)
• 
  L-Leucin
  (Leu / L)
• 
  L-Lysin
  (Lys / K)
• 
  L-Methionin
  (Met / M)
• 
  L
  (Phe / F)
• 
  L-Prolin
  (Pro / P)
• 
  L-Serin
  (Ser / S)
• 
  L-Threonin
  (Thr / T)
• 
  L-Tryptophan
  (Trp / W)
• 
  L-Tyrosin
  (Tyr / Y)
• 
  L-Valin
  (Val / V)

Det følgende er en tabel, der lister et- og tre-bogstavsforkortelser samt kemiske egenskaber for standardaminosyrernes sidekæder. De listede masser er baseret på vægtgennemsnit for de enkelte elementers isotoper, som de er naturligt forekomne. Bemærk at ved dannelsen af en peptidbinding elimineres et vandmolekyle, således at en aminosyres masse i en proteinkæde reduceres med 18,01524 Da. Et-bogstavsforkortelsen for en ubestemt aminosyre er X. Trebogstavsforkortelsen Asx og et-bogstavsforkortelsen B betyder, at den omtalte aminosyre er enten asparagin eller asparaginsyre; Glx og Z betyder enten glutaminsyre eller glutamin; og Xle og J betyder enten leucin eller isoleucin. IUPAC/IUBMB anbefaler nu også at Sec og U refererer til selenocystein, mens Pyl og O refererer til pyrrolysin.

Note: pKa-værdier for en aminosyre er typisk en anelse forskellige, når den befinder sig i forskellige miljøer for eksempel på overfladen og inde i et protein. Protein-pKa-beregning bruges nogle gange til at beregne ændringen i pKa-værdien i en sådan situation.

* UGA er normalt en stopkode, men koder dog for selenocystein, hvis et SECIS-element er til stede.
** Stopkoden er ikke en aminosyre, men er inkluderet for at opnå en komplet oversigt.
*** Mennesker kan ikke syntetisere en essentiel aminosyre og disse må derfor suppleres gennem diæt. Betingede essentielle aminosyrer er ikke normalt nødvendige at få tilført gennem diæt, men må dog suppleres i specifikke populationer, der ikke syntetiserer dem i tilstrækkelig mængde.

• Nelson, David L.; Cox, Michael M. (2000). Lehninger Principles of Biochemistry (3 udgave). Worth Publishers. ISBN 1-57259-153-6.
• Kyte, J.; Doolittle, R. F. (1982). "A simple method for displaying the hydropathic character of a protein". J. Mol. Biol. 157 (1): 105-132. PMID 7108955.

Wikimedia Commons har medier relateret til: Standardaminosyre