Kommunen er beliggende på den nordvestlige del af Rügen, ca. 20 km fra Bergen auf Rügen. Den grænser i nord op til Wieker Bodden og i syd til Udarser Wiek; I vest grænser den op til Schaproder Bodden og i nordvest til Vitter Bodden, der begge er en del af Nationalpark Vorpommersche Boddenlandschaft. Eneste nabokommune til Schaprode er Trent. Det såkaldte „Stolper Haken“ – 4 km nord for landsbyen Schaprode – markerer det smalleste sund mellem øerne Rügen og Hiddensee, idet der kun er 1000 meters afstand mellem stederne.
Landsbyer og bebyggelser
Schaprode
Charlottendorf,
Granskevitz,
Øen Öhe,
Lehsten,
Neuholstein,
Poggenhof,
Retelitz,
Seehof,
Streu
Udars.
Fra Schaprode sejler der færge til den bilfrie ø Hiddensee.