Kromosom 2 (mennesket)

Ideogram over kromosom 2.

Kromosom 2 er et af menneskets 23 kromosompar, og menneskets celler indeholder sædvanligvis to kopier af dette kromosom. Kromosom 2 er det næststørste kromosom hos mennesket, idet det omfatter mere end 242 millioner basepar [1] (DNA's byggesten) og repræsenterer næsten 8% af det samlede DNA i cellerne.

Identificering af generne på hvert kromosom er et aktivt område inden for genforskningen. Eftersom forskerne benytter forskellige metoder til at anslå antallet af gener på hvert kromsom, findes der varierende angivelser af antallet. Kromosom 2 indeholder sandsynligvis i omegnen af 1.192[2] til 1.282[3] protein kodende gener, herunder de, som hører til HOXD homeobox- gengruppen.[4]

Evolution

Uddybende Uddybende artikel: Genomprojekt for chimpanser

Alle medlemmer af den biologiske familie menneskeaber (Hominidae), bortset fra mennesket, har 24 kromosompar, idet mennesket kun har 23 par. Menneskets kromosom 2 er alment accepteret at være resultatet af, at to tidligere kromosomer er blevet til et enkelt ved at hægte deres ender sammen.[5][6]

Sammenhæftning af tidligere adskilte kromosomer efterlod tydelige rester af telomerer og en ekstra, rudimentær centromer.

Denne opfattelse er begrundet i følgende forhold:

  • Overensstemmelsen mellem kromosom 2 og to selvstændige kromosomer hos aberne. Menneskets nærmeste slægtning hos dyrene, den almindelige chimpanse, har dna-sekvenser, som er næsten helt identiske med menneskets kromosom 2, men de findes på to selvstændige kromosomer. Det samme gælder for de mere fjerntstående arter gorillaen og orangutangen. [7][8]
  • Tilstedeværelsen af et rudimentært centromer (et centromer er en indsnævning på et kromosom, som udgør et hæftningspunkt for proteintråde under mitose). Et kromosom har normalt kun en centromer, men på kromosom 2 er der rester af endnu et centromer. [9]
  • Tilstedeværelsen af rudimentære telomerer. Disse findes normalt kun i et kromosoms ender, men i kromosom 2 er der yderligere telomer-sekvenser midt på. [10]

Opbygningen af kromosom 2 anses derfor for en stærk støtte til opfattelsen af, at mennesket og aberne har en fælles forfader. Ifølge forskeren J. W. IJdo: "We conclude that the locus cloned in cosmids c8.1 and c29B is the relic of an ancient telomere-telomere fusion and marks the point at which two ancestral ape kromosoms fused to give rise to human kromosom 2."[10]


Gener

De følgende gener findes på kromosom 2:

GenBeskrivelse
ABCA12ABC-tranportør (ATP-bindende proteinfamilie), underfamilie A (ABC1), medlem 12
ABCG5 og ABCG8ABC-tranportør, underfamilie A, medlem 5 og 8
AGXTalanin-glyoxylat-aminotransferase (oksalose I; hyperoxaluri I; glycolicaciduri; serin-pyruvat aminotransferase)
ALMS1Alström-syndrom 1
ALS2amyotrofisk lateral sklerose 2 (ungdomstype)
BMPR2morfogenetisk knogleproteinreceptor, type II (serin/threonin kinase)
COL3A1kollagen, type III, alfa 1 (Ehlers-Danlos-syndrom type IV, autosomal dominant)
COL4A3kollagen, type IV, alfa 3 (Goodpasture antigen)
COL4A4kollagen, type IV, alfa 4
COL5A2kollagen, type V, alfa 2
HADHA3-hydroxyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunktionelt protein), alfa underenhed
HADHB3-hydroxyl-CoA dehydrogenase/3-ketoacyl-CoA thiolase/enoyl-CoA hydratase (trifunktionelt protein), beta underenhed
MSH2mutS homolog 2, kolorektal cancer, non-polypøs type 1 (E. coli)
MSH6mutS homolog 6 (E. coli)
NR4A2kernereceptor underfamilie 4, gruppe A, medlem 2
OTOFotoferlin
PAX3Pax-gen 3 (Waardenburg-syndrom 1)
PAX8Pax-gen 8
PELI1Ubiquitin ligase
SLC40A1opløsningstransportør (SLC - membrantransport-proteingruppe), familie 40 (jern-reguleret transportør), medlem 1
TPOthyreoperoxidase
TBR1T-box, hjerne, 1

Relaterede sygdomme og uregelmæssigheder

Nedenstående sygdomme har sammenhæng med fejl i gener, som hører til kromosom 2:[11]

  • Arvelig ikke-polypøs kolorektal cancer
  • Autisme
  • Alport-syndrom
  • Alström-syndrom
  • Amyotrofisk lateral sklerose
  • Amyotrofisk lateral sklerose - ungdomstype
  • Amyotrofisk lateral sklerose, type 2
  • Døvhed (non-syndromisk)
  • Døvhed (non-syndromisk, autosomal recessiv)
  • Ehlers-Danlos-syndrom
  • Klassisk Ehlers-Danlos-syndrom
  • Vaskulær Ehlers-Danlos-syndrom
  • Fibrodysplasia ossificans progressiva
  • Ichthyosis, harlekin-type
  • Hæmokromatose
  • Hæmokromatose, type 4
  • Infantile-onset ascending hereditary spastic paralysis
  • Langkædet 3-hydroxyl-CoA dehydrogenasemangel
  • Medfødt hypotyreose (hypothyreoidisme)
  • Mitokondriel trefunktionel proteinmangel
  • MODY-diabetes (Maturity-onset diabetes of the young, diabetes type 6)
  • Oksalose (primær hyperoxaluri type 1)
  • Højt blodtryk i lungekredsløbet (primær pulmonal hypertension)
  • Sitosterolæmi (også kaldet fytosterolæmi, enten ABCG5 eller ABCG8 er ude af funktion)
  • Synæstesi
  • Waardenburg-syndrom

Kilder

  1. ^ http://vega.sanger.ac.uk/Homo_sapiens/mapview?chr=2 Chromosome size and number of genes derived from this database, Tilgået Januar 2018.
  2. ^ "Search results - 2[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBISerier . 2016-09-08. Hentet 2018-01-11.
  3. ^ "Search results - 2[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Hentet 2018-01-11.
  4. ^ Vega Homo sapiens Oversigt over Kromosom 2
  5. ^ Human Chromosome 2 is a fusion of two ancestral kromosoms (Webside ikke længere tilgængelig) af Alec MacAndrew; tilgået 18. maj 2006.
  6. ^ Bevis for fælles afstamning: Menneskets kromosom 2 (video) 2007
  7. ^ Yunis and Prakash; Prakash, O (1982). "The origin of man: a chromosomal pictorial legacy". Science. 215 (4539): 1525-1530. doi:10.1126/science.7063861. PMID 7063861.
  8. ^ Human and Ape Chromosomes Arkiveret 6. september 2017 hos Wayback Machine; tilgået 8. september 2007.
  9. ^ Avarello; Pedicini, A; Caiulo, A; Zuffardi, O; Fraccaro, M; et al. (1992). "Evidence for an ancestral alphoid domain on the long arm of human kromosom 2". Human Genetics. 89 (2): 247-9. doi:10.1007/BF00217134. PMID 1587535. {{cite journal}}: Eksplicit brug af et al. i: |author= (hjælp)
  10. ^ a b IJdo; Baldini, A; Ward, DC; Reeders, ST; Wells, RA; et al. (1991). "Origin of human kromosom 2: an ancestral telomere-telomere fusion". Proceedings of the National Academy of Sciences. 88 (20): 9051-5. doi:10.1073/pnas.88.20.9051. PMC 52649. PMID 1924367. {{cite journal}}: Eksplicit brug af et al. i: |author= (hjælp)
  11. ^ National Institutes of Health. "Conditions related to genes on chromosome 2". Genetics Home Reference. Arkiveret fra originalen 21. august 2011. Hentet 29. august 2010.


Medier brugt på denne side

Chromosome2 merge.png
Made by Evercat, 8 September, 2007. Released public domain by Evercat. Diagram of ancestral fusion forming Human Chromosome 2.