Kapsid

Model af Semliki Forest virus, prototypen på en ssRNA(+)-virus
Model af Poliovirus, prototypen på en ssRNA(+)-virus
Model af Zikavirus, prototypen på en ssRNA(+)-virus

En kapsid er en beskyttende skal af proteiner omkring genomet i en virus . Det består for de fleste virus af underenheder kaldet kapsomerer, der opbygger en symmetrisk form.

Kapsider klassificeres stort set efter deres struktur. Størstedelen af virus har kapsider med spiralformet eller icosahedral struktur. Nogle virus har udviklet mere komplicerede strukturer, som f.eks. bakteriofager.

Kapsidfladerne kan bestå af et eller flere proteiner. F.eks. har mund- og klovsygevirus en kapsid, der består af tre proteiner kaldet VP1, VP2 og VP3.

Nogle virus kan yderligere have en membrankappe (lipid-kappe) afledt af værtens cellemembran, hvori der er indlejret proteiner kodet af virusgenomet. Også kapsidens proteiner er kodet af det virale genom. Der kan også indbygges yderligere strukturproteiner i virionet eller proteiner der fungerer ved produktionen af viruskomponenterne.

Bånddiagram af kapsidet fra Adenoassocieret virus-2 (AAV2). Kapsidproteinerne VP1, VP2 og VP3 udtrykkes i forholdet 1:1:20


Autoritetsdata

Medier brugt på denne side

Zika-chain-colored.png
Forfatter/Opretter: Manuel Almagro Rivas, Licens: CC BY-SA 4.0
Zika virus capsid, colored per chains.

Source: Sirohi, D., Chen, Z., Sun, L., Klose, T., Pierson, T., Rossmann, M. and Kuhn, R. (2016). The 3.8Å resolution cryo-EM structure of Zika virus. DOI: 10.2210/pdb5ire/pdb Available at: http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=5IRE [Checked on 3 Apr. 2016]

Image created using QuteMol and GIMP.
AAV2 Ribbon Diagram.jpg
Forfatter/Opretter: Jazzlw, Licens: CC BY-SA 4.0
AAV2, shown as a ribbon diagram, with the back half hidden for clarity. From PDB structure 1LP3
Polio-3-chains.png
Forfatter/Opretter: Manuel Almagro Rivas, Licens: CC BY-SA 4.0
Type 3 poliovirus capsid, colored per chains.

Source: Structural factors that control conformational transitions and serotype specificity in type 3 poliovirus. Filman, D.J., Syed, R., Chow, M., Macadam, A.J., Minor, P.D., Hogle, J.M. (1989) EMBO J. 8: 1567-1579.

Available at: http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=2PLV [Checked on 26 Apr. 2016]

Image created using QuteMol and GIMP.
Emd-1017.jpg
Forfatter/Opretter: A2-33, Licens: CC BY-SA 3.0
Cryo-electron microscopy reconstruction of Semliki Forest virus at 9A resolution. From EMD-1015