G-protein-koblede receptorer

Animeret model af membrandelen af en 7TM receptor, κ-Opioid-receptoren med en antagonist
Krystalstrukturen af den ativerede beta-2 adrenerge receptor (rød) med G-proteiner: Gα (grøn), Gβ (cyan) og Gγ (gul)
En 2-D tegning af en GPCR (perlekæden)i en cellemembran. Hver perle er en aminosyre.
Tegning der viser hvordan binding af en ligand medfører ændringer i konformationen af GPCR, set både udefra og indefra
Strukturen af de to cannabinoide receptorer CB1 and CB2
NMR struktur af bovin rhodopsin

GPCR er beskrevet som den mest livsnødvendige gruppe proteiner.[1] Forkortelsen står for G-protein–coupled receptor, på dansk G-protein-koblede receptorer. Disse receptorer er prominente medlemmer af en familie af membramproteiner kaldet 7TM - et kort navn for 7 transmembrane receptorer. Dette navn kommer af, at receptormolekylet slynger sig som en slange syv gange gennem cellemembranen (se billederne). At et protein er G-koblet vil sige at det bruger GTP (Guanosintrifosfat) til at tilføre energi for at udføre sit arbejde, i modsætning til mange proteiner, som normalt bruger ATP.

Alle G-protein-koblede receptorer sidder i cellemembranen og er populært sagt cellernes "dørvogtere". Ved binding af en ligand ændrer receptoren konformation og aktiverer et G-protein[2] der udløser et biokemisk, cellulært respons, der kan tage mange veje og omtales som signaltransduktion.[3] Ligander kan være fotoner, smagsstoffer, duftstoffer, hormoner, lægemidler, kemikalier.

Hos mennesket og pattedyr er der en superfamilie af omkring 800 G-protein-koblede receptorer, der på det molekylære niveau tager vare på utallige vigtige reaktioner i og mellem organismens celler.[4] Velkendte eksempler er syns-receptoren rhodopsin og hormonreceptoren for adrenalin. Selv om der ikke synes megen lighed mellem opfattelsen af sansindtryk og hormoners virkning, har de lignende receptorer: 7TM strukturen er fælles med homologi af aminosyresekvensen.

Nobelprisen i kemi blev i 2012 tildelt Brian Kobilka og Robert Lefkowitz for deres arbejde med GPCR og deres funktion.[5] [6] [7]

Mange funktioner

Mange eksempler

"The human protein atlas" beskriver 774 humane G-proteinkoblede receptorer[10] her er nogle eksempler:

  • Dopamin-receptorerne består af mindst to familier af G-protein-koblede receptorer i det centrale nervesystem (CNS) og spiller en rolle i mange neurologiske processer som motivation, glæde, kognition (tænkning), indlæring, hukommelse, bevægelseskontrol og modulering af neuroendocrin signalering.
  • Receptorer for feromoner er lokaliseret i det vomeronasale organ og der er identificeret tre familier af receptorer: V1R (VN1R1; VN1R2; VN1R3; VN1R5), V2R og V3R.
  • CXCR4, chemokin-receptor type 4 er en cytokinreceptor og findes på overfladen af celler i det centrale nervesystem og immunsystemet og vides at være involveret i 23 kræftformer og to immunsygdomme, hvorfor denne receptor er blevet studeret flittigt som mål for lægemidler.[12]
  • CCR5-delta32, CCR5-Δ32 er en meget sjælden mutation af receptoren CCR5, hvor 32 aminosyrer mangler, således at HIV ikke kan binde sig til receptoren og trænge ind i cellerne.[15][16]
  • OR2AT4 er receptor for et syntetisk duftstof kaldet sandalore, som starter en kaskade af molekylære signaler, der synes at inducere reparationen af skadet væv.[8]

Farmaka og GPCR

Meget medicin retter sig mod GPCR og meget forskning drejer sig om GPCR på grund af deres mange vigtige funktioner.

Andre virkningsmekanismer kan være farmaka som enzymhæmmere, der griber ind i en signalvej over en GPCR, som f.eks. aspirin, der hæmmer enzymet cyclooxygenase, der danner de smerte-signallerende molekyler kalder prostaglandiner.

Se også

Eksterne links og henvisninger

  1. ^ "Exploring the Elusive World of Life's Most Vital Proteins. Livescience". Arkiveret fra originalen 11. august 2014. Hentet 14. august 2014.
  2. ^ "G Proteins. Molecule of the Month. Protein Data Bank". Arkiveret fra originalen 18. januar 2015. Hentet 8. januar 2015.
  3. ^ Seven-Transmembrane-Helix Receptors Change Conformation in Response to Ligand Binding and Activate G Proteins. Biochemistry
  4. ^ "Exploring the Elusive World of Life's Most Vital Proteins. NIH". Arkiveret fra originalen 5. april 2015. Hentet 8. januar 2015.
  5. ^ "The Nobel Prize in Chemistry 2012". Arkiveret fra originalen 12. oktober 2012. Hentet 14. august 2014.
  6. ^ "Cells and sensibility" (PDF). Arkiveret (PDF) fra originalen 8. oktober 2014. Hentet 14. august 2014.
  7. ^ "Studies of G-protein coupled receptors" (PDF). Arkiveret (PDF) fra originalen 26. september 2014. Hentet 14. august 2014.
  8. ^ a b "Smell Turns Up in Unexpected Places. The New York Times Science". Arkiveret fra originalen 27. oktober 2014. Hentet 19. oktober 2014.
  9. ^ "Peptide Hormone G Protein-Coupled Receptors. R&D systems". Arkiveret fra originalen 17. august 2014. Hentet 15. august 2014.
  10. ^ "G-protein coupled receptors. The human protein atlas". Arkiveret fra originalen 2. april 2015. Hentet 12. marts 2015.
  11. ^ "Cannabis Receptor May Be More Flexible Than We Originally Thought. IFLScience 2017". Arkiveret fra originalen 9. juli 2017. Hentet 9. juli 2017.
  12. ^ "Chemokine receptor type 4 (CXCR4): diseases, drugs and druggable target molecules. Protein Focus". Arkiveret fra originalen 25. september 2015. Hentet 8. januar 2015.
  13. ^ "CRISPR: En genetisk schweizerkniv, som kan ændre menneskeheden for altid. Information 2018". Arkiveret fra originalen 19. juni 2019. Hentet 19. juni 2019.
  14. ^ "CRISPR Scientists Slam Methods Used on Gene-Edited Babies. The Scientist 2018". Arkiveret fra originalen 27. juli 2020. Hentet 8. juli 2020.
  15. ^ "Only 1 Person Has Been Cured of HIV: New Study Suggests Why. Livescience". Arkiveret fra originalen 28. september 2014. Hentet 27. september 2014.
  16. ^ "Genetic Mutation that Prevents HIV Infection Tied to Earlier Death. The Scientist 2019". Arkiveret fra originalen 1. november 2019. Hentet 4. juni 2019.

Medier brugt på denne side

4DJH anim.2.gif
Forfatter/Opretter: Dcirovic, Licens: CC BY-SA 3.0
An animated view of the PDB 4DJH structure showing the human k-opioid receptor in complex with the JDTic ligand.
GPCR activation.jpg
Forfatter/Opretter: Repapetilto, Licens: CC BY-SA 3.0
Cartoon of GPCR Conformational Activation. Ligand binding disrupts an ionic lock between the E/DRY motif of TM-3 and acidic residues of TM-6. As a result the GPCR reorganizes to allow activation of G-alpha proteins. The side perspective is a view from above and to the side of the GPCR as it is set in the plasma membrane (the membrane lipids have been omitted for clarity). The intracellular perspective shows the view looking up at the plasma membrane from inside the cell. Based on information found in Mol. Endocrinol. 2010 24:261-274

Abbreviations, etc:

GPCR domains:

IL-1 to IL-3= Intracellular loops 1-3

EL-1 to EL-3= Extracellular loops 1-3


Other:

G-alpha= Alpha subunit of a heterotrimeric G-protein

G-beta/gamma= G-beta/gamma heterodimer of heterotrimeric G-protein

The figure is based on information found in the review article "The Year In G Protein-Coupled Receptor Research" Molecular Endocrinology 24 (1): 261-274. (2010)
GPCR in membrane.png
Forfatter/Opretter: Repapetilto, Licens: CC BY-SA 3.0
This Cartoon depicts a generic GPCR as it may be found within the plasma membrane localized to a lipid raft. It is a 2-dimensional schematic highlighting select structural features that are important to the biological function of many different GPCRs.


Abbreviations, etc:

Branched N-glycan

Filled black Squares= N-acetylglucosamine

Unfilled Circles= Mannose


Each circle making up the long chain represents an amino acid. The peptide motifs are represented by filled circles and labeled using commonly accepted single-letter abbreviations for each amino acid.

N= Asparagine,

x= any amino acid,

S/T= Serine or Threonine,

C= Cysteine (attached S represents an oxidized sulfhydryl group),

E/D= Glutamate or Aspartate,

Y=Tyrosine,

R/K= Arginine or Lysine


GPCR domains:

IL-1 to IL-3= Intracellular loops 1-3

EL-1 to EL-3= Extracellular loops 1-3


Other Proteins:

G-alpha= Alpha subunit of a heterotrimeric G-protein

G-beta/gamma= G-beta/gamma heterodimer of heterotrimeric G-protein

PKC= Protein Kinase C

PKA= Protein Kinase A

GRK= G-protein Coupled Receptor Kinase (GPCR kinase)


Final note: The consensus sequence for PKC phosphorylation is written in the legend from C to N terminus, while the other motifs are all shown as N to C. Actually Im not sure if this matters or not...
Beta2Receptor-with-Gs.png
Crystal structure of activated beta-2 adrenergic receptor in complex with Gs. The receptor is colored red, Gα green, Gβ cyan and Gγ yellow. T4 Lysozyme and nanobody, which were used to facilitate crystallization, are omitted for clarity. Note that the C-terminus of Gα is located in a cavity created by an outward movement of the cytoplasmic parts of TM5 and 6. Rendered from PDB entry 3SN6.
Cb1 cb2 structure.png
(c) Esculapio at the Italian language Wikipedia, CC BY-SA 3.0
Struttura dei recettori cannabinoidi CB1 e CB2.
Rhodopsin.jpg
3D structure of bovine rhodopsin. Derived from the 2.6 Å crystal stucture of rhodopsin (1L9H). Structural informations were obtained from pdb.org and modelled using spdbv/POV Ray.
Blue: TMI.
Lightblue: TMII.
Cyan: TMIII.
Green: TMIV.
Yellow: TMVV.
Organge: TMVI.
Red-orange: TMVII.
Red: Hx8.