Escherichia coli O104:H4

Escherichia coli O104:H4 er en verotoksin-producerende Escherichia coli og er (pr. 2011) en sjælden serotype af bakteriearten Escherichia coli.

E. coli O104:H4 varianten fra 2011-udbruddet

Genomisk sekvensering af BGI-Shenzhen afslørede at bakterievarianten O104:H4 der var årsagen til E. coli-udbruddet i 2011, tilhører til en "super-giftig stamme", som bl.a. har nogle virulente muligheder fra en anden patogen E. Coli; enteroaggregative E. coli (EAEC 55989) [1] og fra andre stammer sandsynligvis via horisontal genoverførsel. [2][3] [4] [5] [6] Stammen lader ikke til at være ny, baseret på to DNA-sekventeringer, da den (næsten) er identisk med E. coli ST678 fundet i 2001. [7] [8] [9] [10]

Det bemærkelsesværdige ved O104:H4 fra 2011 er, at flere (ca. 1/3) får hæmolytisk-uræmisk syndrom end med andre STEC-stammer, hvor kun 10% får hæmolytisk-uræmisk syndrom. Hæmolytisk-uræmisk syndrom medfører blodig diarré (dysenteri) og colitis og i værste fald nyresvigt og død, grundet det aktive giftstof kaldet verotoksin.

Historisk

Der er dokumenteret et tilfælde af sygdom grundet denne bakterie, det var da en koreansk kvinde blev syg i 2005. [11]

Kilder/referencer

  1. ^ "03.06.2011, Deutsche Welle: Scientists seek answers from origins of 'chimeric' E. coli". Arkiveret fra originalen 7. juni 2011. Hentet 4. juni 2011.
  2. ^ "BGI Sequences Genome of the Deadly E. Coli in Germany and Reveals New Super-Toxic Strain". BGI. 2011-06-02. Arkiveret fra originalen 6. juni 2011. Hentet 2011-06-02.
  3. ^ David Tribe (2011-06-02). "BGI Sequencing news: German EHEC strain is a chimera created by horizontal gene transfer". Arkiveret fra originalen 27. maj 2012. Hentet 2011-06-02.
  4. ^ "1.6.2011, rki.de: Characterization of EHEC O104:H4" (PDF). Arkiveret (PDF) fra originalen 31. august 2011. Hentet 3. juni 2011.
  5. ^ 2. jun 2011, ing.dk: Kinesisk genanalyse: Tysk agurke-bakterie er en helt ny superstamme (Webside ikke længere tilgængelig) Citat: "...denne E.coli er en ny stamme, der er meget infektiøs og giftig...Kilden til udbruddet er endnu ikke fundet..."
  6. ^ 3. jun 2011, ing.dk: Agurkebakterie er resistent mod otte antibiotika (Webside ikke længere tilgængelig) Citat: "...De nye analyser viser også, at bakteriens genom består af en mosaik af gener fra forskellige bakteriestammer. Det bekræftes, at serotypen er 0104..."
  7. ^ Eurosurveillance, Volume 16, Issue 21, 26 May 2011: Large and ongoing outbreak of haemolytic uraemic syndrome, Germany, May 2011 Arkiveret 2. juni 2011 hos Wayback Machine Citat: "...All were sequence-typed as ST678 (stx1-, stx2+, eae-, flagellin-coding gene flicH4), group HUSEC 41, also indicating serotype O104 [2,3]..." (i pdf – første artikel Arkiveret 28. maj 2011 hos Wayback Machine)
  8. ^ 02.06.11, fpn.dk: Dansk ekspert: Bakterien er ikke ny Arkiveret 3. juni 2011 hos Wayback Machine Citat: "...Statens Serum Institut afviser meldinger om, at den dødelige VTEC-colibakterie er en helt ny bakterieart..."
  9. ^ Mikrobiologisk orienteret: June 2, 2011, pathogenomics.bham.ac.uk: EHEC Genome Assembly Arkiveret 7. juni 2011 hos Wayback Machine Citat: "...Mike the Mad Biologist has looked at the TY2482 assembly and concludes it is ST678 (or closely related) which agrees with the original molecular typing release from the Robert Koch Institute..."
  10. ^ June 3, 2011, ehecinfection.com: EHEC outbreak is E.Coli ST678 (Webside ikke længere tilgængelig) Citat: "...The current outbreak strain exhibits the same behavior (so-called aggregative adherence) in the attachment to the cells of the intestinal wall, like his predecessor from 2001..."
  11. ^ Bae WK, Lee YK, Cho MS, Ma SK, Kim SW, Kim NH; et al. (2006-06-30), "A case of haemolytic uremic syndrome caused by Escherichia coli O104:H4", Yonsei Medical Journal (engelsk) (3 udgave), vol. 47, s. 473–479, doi:10.3349/ymj.2006.47.3.437, PMID 16807997 {{citation}}: Eksplicit brug af et al. i: |forfatter= (hjælp)CS1-vedligeholdelse: Flere navne: authors list (link)