Endogen retrovirus

Familietræ over de syv slægter af retrovirus og de tre slægter af endogene retrovirus (mærket Class I, Class II, Class III)

Endogene retrovirus, ERV eller HERV (efter human endogen retrovirus) eller retrotransposoner er sekvenser af DNA, der kan føres tilbage til retrovirus, der har inficeret tidligere generationer og er blevet integreret i genomet - ofte for flere millioner af år siden, for derefter at medvirke til evolutionen af arterne.

I modsætning til retrovirus danner endogene retrovirus ikke infektiøse viruspartikler, men bliver inden for cellen som funktionelle sekvenser eller sekvenser uden kendt funktion.

Humane endogene retrovirus udgør en betragtelig del af det humane genom med op til 100.000 fragmenter, der tilsammen udgør 5–8% af genomet, og er flytbare elementer, transposoner, der flyttes rundt i genomet og udfylder vigtige roller i gen-udtrykket og den vævsspecifikke gen-regulering.

Endogene retrovirus menes helt bestemt at være faktorer i udviklingen af visse typer af cancer og autoimmune sygdomme.[1][2]

Betydning for evolutionen

Forskere spekulerer på hvor stor betydning de mange endogene retrovirus mon har haft for evolutionen, da der ikke er tvivl om, at retrovirus-proteiner er blevet antaget af værtsorganismer igennem millioner af år for at udfylde nye funktioner.

LTR-sekvenser (long terminal repeat), der er transskriptions-elementer (jvf proteinsyntese), virker ofte som en alternativ promotor og bidrager til at udtrykke vævsspecifikke proteiner.

Nogle eksempler

  • Syncytinerne: Syncytin-1 (enverin) og syncytin-2, en gruppe retrovirus-proteiner, der er fusions-proteiner, som virker i placenta og i forbindelse med fosteret.
  • Hemo, et retrovirus-protein af ukendt funktion i fosteret og placenta.[3]

Se også

Referencer

  1. ^ "Demystified . . . Human endogenous retroviruses. Molecular Pathology 2003". Arkiveret fra originalen 10. februar 2019. Hentet 24. februar 2018. 
  2. ^ "Human Endogenous Retroviruses and Disease. The Scientist 2020". Arkiveret fra originalen 23. juli 2020. Hentet 28. januar 2020. 
  3. ^ "Ancient Viruses Are Buried in Your DNA. New York Times Science 2017". Arkiveret fra originalen 19. januar 2018. Hentet 23. januar 2018. 

Medier brugt på denne side

Classes of ERVs.svg
Forfatter/Opretter: , Licens: CC BY 2.0
Representative unrooted Pol neighbor joining (NJ) dendrogram. Unrooted Pol neighbor joining (NJ) dendrogram (500 bootstraps consensus) of the seven retroviral genera: alpha-, beta-, gamma-, delta-, epsilon-, lenti- and spuma-like retroviruses. The somewhat more loosely defined (endogenous) retroviral classes are indicated in the periphery. The various host species are indicated with symbols next to each taxonomic unit. The novel sequences are named according to their chromosomal positions within respective genomes. (hg15 and 16: Human genome; gg01: Chicken genome and pt01: chimpanzee genome). The two pt01 sequences were unique to chimpanzee and not found in humans