SARS-CoV-2

Denne artikel er om et virus. For sygdommen se COVID-19. For udbruddet af denne virus, se coronaviruspandemien i 2019-2020.


Novel Coronavirus (SARS-CoV-2)
Novel Coronavirus (SARS-CoV-2).
Novel Coronavirus (SARS-CoV-2).
Videnskabelig klassifikation
DomæneVira (Virus)
(urangeret)Gruppe IV (+ssRNA)
OrdenNidovirales
FamilieCoronaviridae
SlægtCoronavirus
Arter
  • Novel Coronavirus (SARS-CoV-2)
Hjælp til læsning af taksobokse

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2),[1][2] tidligere midlertidigt navngivet 2019-novel-coronavirus eller 2019-nCoV[3][4] og uformelt kendt som Wuhan-coronavirus,[5][6] er en ny type Corona-virus i familie med SARS. SARS-CoV-2 er en smitsom virus, som kan forårsage COVID-19, en luftvejsinfektion, som kan udvikle sig til Langvarig COVID-19.

SARS-CoV-2 blev oprindeligt identificeret i midten af december 2019 i millionbyen Wuhan i det centrale Kina efter mange mennesker fik lungebetændelse af ukendte årsager, primært knyttet til dem, der arbejdede på Huanan Seafood Market (華南 海鮮 市場), hvor der sælges levende dyr. Kinesiske forskere isolerede derefter den nye coronavirus SARS-CoV-2, som har vist sig at være mindst 70 % identisk med gensekvensen hos SARS-CoV. Den har dog endnu ikke vist sig at være så alvorligt eller så dødbringende som SARS. 20. januar 2020 bekræftede de kinesiske myndigheder og WHO, at virussen kan smitte fra menneske-til-menneske,[7] Og med 7.700 personer smittet og 170 dødsfald erklærede WHO d. 30. januar 2020 den potentielt dødelige SARS-CoV-2 for en international sundhedskrise.[8] I slutningen af januar vurderede kinesiske myndigheder virusset til at være en kategori B-sygdom på linje med AIDS, SARS og polio. Ikke desto mindre håndterede myndighederne det som en kategori A-sygdom, som Kina ellers kun har to af, nemlig kolera og byldepest.[9]

Oprindelse

Den 22. januar 2020 udgav Journal of Medical Virology en rapport med en genomisk analyse, som overvejer at slanger i Wuhan-området er citat: "the most probable wildlife animal reservoir" for virussen. Mere forskning på området er dog påkrævet.[10][11]

En homolog rekombinationshændelse kan have blandet en "clade A"-virus (flagermus SARS-lignende vira CoVZC45 og CoVZXC21) med RNA-binding af en indtil videre ukendt Beta-CoV.[12][13]

SARS-CoV-2's formodede genomorganisation. (GenBank-nummer MN908947)[14]

Isolaten Wuhan-Hu-1 (GenBank-nummer MN908947[14]) af SARS-CoV-2 viser store fylogenetiske ligheder med to coronavirus-isolater fra kinesiske flagermus, som blev karakteriseret i 2015 og 2017.[15]

Isolatens virusgenom omfatter 29.875 bp med 281 bp henholdsvis 325 bp lange uoversatte områder ved 5'-enden og henholdsvis 3'-enden. De formodede kodende områder fordeler sig på 10 proteiner: et 7096 aminosyre langt ORF1ab-polyprotein, et 1282 aminosyre langt overflade-glykoprotein kaldet spike, et 75 aminosyre hylsterprotein (E), et 222 AS membranglykoprotein (M), et 419 AS nukleokapsid-fosfoprotein og yderligere 5 proteiner (ORF3a, ORF6, ORF7a, ORF8 og ORF10). Disse udgør genfølgen i SARS-virus og alle coronavira.[16]

Varianter

Helgenomssekventering af SARS-CoV-2 og indføring i databaser kan give et overblik over genetiske mutation i virussens genom. GISAID-databasen indeholder sådanne genomdata og analyser af genomet ses også i forbindelse med Nextstrain.[17]

Det findes [mindst] titusindvis[18] af varianter af virusset.[19] I Norden har man fundet varianter af virusset; således har man i Norge konstateret "over 40"[20] variationer.[21]

En person med svækket immunsystem fik igennem sit COVID-19-sygdomsforløb en længere række af mutationer, særligt i spike-proteinet.[22]

Før Omicron-varianten viste sig i mennesker i Sydafrika i 2021, kan den have udviklet sig i dyr. Det usædvanligt store antal mutationer sammenlignet med den originale variant - omkring 50, inklusive mere end 30 i Spike-proteinet, dvs. næsten tre gange så mange som Delta-varianten - antyder en udvikling i en usædvanlig vært, jf. minksagen og zoonose.

Notable varianter
  • B.1.617 er den dominerende variant i Indien [63]
  • B.1.617.2. varianten kendes som “delta” og er mere smitsom [64]
  • udviklingslinje P.1 blev opdaget i Tokyo d. 6. januar 2021 af Kokuritsukansenshōkenkyūjo (NIID). Variant fra denne udviklingslinje blev først identificeret i fire personer, der ankom Tokyo efter at have rejst fra Amazonas (delstat i Brasilien), d. 2. januar 2021.[65][66]


Oversigt
First detectionKlassificering
(Rambaut et al.)		Andre navneNotable mutationerRef.
StedDato
Nigeria Nigeriaaug 2020B.1.1.207P681H[2]
Storbritannien Storbritanniensep 2020B.1.1.7VOC-202012/01, 20I/501Y.V1N501Y, 69–70del, P681H[2][67][68][69]
Danmark Danmarkokt 2020B1.1.298Cluster 5, ΔFVI-spike (SSI), Covid-19-minkvarianter, DCGC-3024/2020, en af fem danske mink-varianter (cluster1-5)Y453F, I692V, M12291I, 69–70deltaHV[24][26][27]
Sydafrika Sydafrikadec 2020B.1.351501.V2, 20H/501Y.V2,

VOC-202012/02

N501Y, K417N, E484K[2][50][70][67][71][72][73]
Storbritannien Storbritannien
Nigeria Nigeria		dec 2020B.1.525VUI-202102/03 (PHE), tidligere UK1188E484K, F888L[70][62][59]
USA USAjan 2021B.1.429Q677H, S:Q677H, 677, Q677, B.1.429+S:Q677H[74][75][76][77]
Japan Japan
Brasilien Brasilien		jan 2021P.1Stammer fra B.1.1.28N501Y, E484K, K417T[78][79][65][80][67]
USA USAmar 2021Q677P677 eller Q677P stammer fra B.1.429[81][82]“Pelican”, “Robin” (Robin 1, Robin 2), “Yellowhammer”, ”Bluebird”, ”Quail” og “Mockingbird”[83][84][76][85]
Storbritannien Storbritannienapr 2021B.1.1.7B1.1.7, “Cluster B117”[86][62][87]
USA USAmar 2021
apr 2021		B1.526526B1 (526-537) (STJ72853), P.1; P.2.[88][76][89]


WHO navngivning af varianter

I nyhedsmedierne blev flere varianter navngivet efter det land, som varianten først blev konstateret i, for eksempel den "britiske variant" eller "engelske variant" for (B.1.1.7) og senere blandt andre også en "sydafrikansk" (B.1.351) og en "indisk" (B.1.617.2). Den Indiske regering beklagede i maj 2021, at mutationer fik landenavne. Den 31. maj besluttede WHO at mutationerne i stedet skulle benævnes med bogstaver fra det græske alfabet, således kom den "britiske variant" til af hedde "alpha", den "sydafrikanske variant" blev til "beta" og den "indiske variant" benævnt som "delta".[90]

Notable missense-mutationer

Missense-mutationer:

  • D614G: En af de betydelige ændringer i SARS-CoV-2-genomet under COVID-19-pandemien forekom i receptorbindingsdomænet, nærmere bestemt spike-proteinets D614G-mutation. D614-varianten dominerede oprindeligt men blev udkonkurreret af G614-varianten.[91]
  • E484K[72][65][92][93], mutationen dannes på spike-proteinet på overfladen af virusset. Denne ændringen findes hos den [såkaldte] sydafrikanske variant og hos den [såkaldte] brasilianske variant, skriver medierne.[94]

Nomenklatur af varianter

Nomenklatur [105]
Pango udviklingslinjerRambaut et al.[106]Nextstrain klade, 2021[107]GISAID kladeNotable varianter
A.1–A.619BSinkluderer "sekvens null" (sequence zero)[108]
B.3–B.7, B.9, B.10, B.13–B.1619AL
O[a]
B.2V
B.1B.1.5–B.1.7220AGUdviklingslinje B.1 hos Rambaut et al.
B.1.9, B.1.13, B.1.22, B.1.26, B.1.37GH
B.1.3–B.1.6620CInkluderer CAL.20C[55]
20G
20HI 501.V2 også kendt som (20C/501Y.V2 or) 20H/501Y.V2 eller B.1.351 lineage
B.1.120BGRInkluderer B.1.1.207
20DInkluderer P.1 og P.2[109]
20F
20IInkluderer VOC-202012/01 også kendt som (20B/501Y.V1 eller) 20I/501Y.V1 eller udviklingslinje B.1.1.7
B.1.17720E (EU1)[107]GV[a]Fra 20A[107]


Se også

Kilder/henvisninger

  1. ^ Gorbalenya, Alexander E. (2020-02-11). "Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus – The species and its viruses, a statement of the Coronavirus Study Group". bioRxiv (engelsk): 2020.02.07.937862. doi:10.1101/2020.02.07.937862. Citat: "...the human pathogen tentatively named 2019-nCoV. Based on phylogeny, taxonomy and established practice, the CSG formally recognizes this virus as a sister to severe acute respiratory syndrome coronaviruses (SARS-CoVs) of the species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirusand designates it as severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)...In this study, we present an assessment of the novelty of 2019-nCoV and detail the basis for(re)naming this virus severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2, which will be used hereafter..."
  2. ^ a b c d "Coronavirus disease named Covid-19". BBC News (britisk engelsk). 2020-02-11. Hentet 2020-02-11. Citat: "..."We now have a name for the disease and it's Covid-19," WHO chief Tedros Adhanom Ghebreyesus told reporters in Geneva...The virus itself has been designated SARS-CoV-2 by the International Committee on Taxonomy of Viruses..."
  3. ^ World Health Organization (2020). Surveillance case definitions for human infection with novel coronavirus (nCoV): interim guidance v1, January 2020 (Rapport). World Health Organization. hdl:10665/330376. WHO/2019-nCoV/Surveillance/v2020.1.
  4. ^ "Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China". United States: Centers for Disease Control and Prevention (CDC). 10. januar 2020. Arkiveret fra originalen 14. januar 2020. Hentet 16. januar 2020.
  5. ^ Huang, Pien (22. januar 2020). "How Does Wuhan Coronavirus Compare With MERS, SARS And The Common Cold?". NPR.org (engelsk). Arkiveret fra originalen 2. februar 2020. Hentet 2020-02-03.
  6. ^ Fox, Dan (2020). "What you need to know about the Wuhan coronavirus". Nature. doi:10.1038/d41586-020-00209-y. ISSN 0028-0836.
  7. ^ "China confirms human-to-human transmission of new coronavirus". CBC News. 20. januar 2020. Hentet 2020-01-21.{{cite news}}: CS1-vedligeholdelse: url-status (link)
  8. ^ januar 2020, Torsdag d 30; artikel, kl 20 47 Del denne artikel Del denne (30. jan. 2020). "WHO slår alarm: Virus udgør en international sundhedskrise". Berlingske.dk. Hentet 21. maj 2022.
  9. ^ Claus Block Thomsen: "Virusset har nået vesten", Politiken 24. januar 2020
  10. ^ "China coronavirus: Fear grips Wuhan as lockdown begins". BBC. 23. januar 2020. Hentet 21. maj 2022 – via www.bbc.com.
  11. ^ Conversation, Haitao Guo,Guangxiang "George" Luo,Shou-Jiang Gao,The (23. januar 2020). "Snakes could be the source of the Wuhan coronavirus outbreak". CNN. Hentet 21. maj 2022.
  12. ^ Ji, Wei; Wang, Wei; Zhao, Xiaofang; Zai, Junjie; Li, Xingguang (22. januar 2020). "Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human". Journal of Medical Virology. doi:10.1002/jmv.25682.
  13. ^ Haitao Guo; Guangxiang "George" Luo; Shou-Jiang Gao (22. januar 2020). "Snakes could be the original source of the new coronavirus outbreak in China". The Conversation. Hentet 22. januar 2020.
  14. ^ a b ncbi.nlm.nih.gov: Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome Citat: "...This sequence has been updated. See current version..."
  15. ^ "Novel coronavirus complete genome from the Wuhan outbreak now available in GenBank". NCBI Insights (engelsk). 2020-01-13. Hentet 2020-01-14.
  16. ^ Matthew Frieman, Ralph Baric (2008). "Mechanisms of Severe Acute Respiratory Syndrome Pathogenesis and Innate Immunomodulation". Microbiology and Molecular Microbiology Reviews (engelsk). 72: 672-685. doi:10.1128/MMBR.00015-08., open access
  17. ^ "Nextstrain". nextstrain.org. Hentet 21. maj 2022.
  18. ^ Michael Le Page (23. januar 2021) "What are the new coronavirus variants?". New Scientist. S. 9
  19. ^ Koyama, Takahiko; Platt, Daniel; Parida, Laxmi (juni 2020). "Variant analysis of SARS-CoV-2 genomes". Bulletin of the World Health Organization. 98 (7): 495-504. doi:10.2471/BLT.20.253591. PMC 7375210. PMID 32742035. We detected in total 65776 variants with 5775 distinct variants.
  20. ^ Nå har viruset mutert 12.000 ganger. Men mutasjonene har ikke gjort det farligere. (27. november 2020) Aftenposten
  21. ^ "35 coronavarianter oppdaget i Norge". www.vg.no. Hentet 21. maj 2022.
  22. ^ Bina Choi; Manish C Choudhary; James Regan; Jeffrey A Sparks; Robert F Padera; Xueting Qiu; Isaac H Solomon; Hsiao-Hsuan Kuo; Julie Boucau; Kathryn Bowman; U Das Adhikari; Marisa L Winkler; Alisa A Mueller; Tiffany Y-T Hsu; Michaël Desjardins; Lindsey R Baden; Brian T Chan; Bruce D Walker; Mathias Lichterfeld; Manfred Brigl; Douglas S Kwon; Sanjat Kanjilal; Eugene T Richardson; A Helena Jonsson; Galit Alter; Amy K Barczak; William P Hanage; Xu G Yu; Gaurav D Gaiha; Michael S Seaman; Manuela Cernadas; Jonathan Z Li (11. november 2020), "Persistence and Evolution of SARS-CoV-2 in an Immunocompromised Host", New England Journal of Medicine, doi:10.1056/NEJMC2031364, PMID 33176080, Wikidata Q101532842
  23. ^ Tyra Grove Krause (5. november 2020). "Mutationer i minkvirus". Statens Serum Institut. Hentet 7. november 2020.
  24. ^ a b Lassaunière, Ria (11. november 2020). "SARS-CoV-2 spike mutations arising in Danish mink and their spread to humans". Statens Serum Institut. Arkiveret fra originalen 10. november 2020. Hentet 11. november 2020.
  25. ^ "Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink" (PDF). European Centre for Disease Prevention and Control. 12. november 2020. Hentet 12. november 2020.
  26. ^ a b "SARS-CoV-2 mink-associated variant strain – Denmark". World Health Organization. 6. november 2020. Hentet 16. januar 2021.
  27. ^ a b "De fleste restriktioner lempes i Nordjylland" [most restrictions eased in North Jutland]. Sundheds- og Ældreministeriet. 19. november 2020. Hentet 16. januar 2021. Sekventeringen af de positive prøver viser samtidig, at der ikke er påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 siden den 15. september, hvorfor Statens Serums Institut vurderer, at denne variant med stor sandsynlighed er døet ud. ("With high probability [...] died out")
  28. ^ "Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)". CDC (amerikansk engelsk). Centers for Disease Control and Prevention. 2021-01-15. Hentet 2021-01-16.
  29. ^ a b "Detection of SARS-CoV-2 P681H Spike Protein Variant in Nigeria". Virological (amerikansk engelsk). 2020-12-23. Hentet 2021-01-01.
  30. ^ Dansk studie mener britisk mutantvirus er vesentlig farligere (28. februar 2021)
  31. ^ Dansk studie: Britisk mutasjon gir økt risiko for å havne på sykehus (26. februar 2021)
  32. ^ "Covid: Ireland, Italy, Belgium and Netherlands ban flights from UK". BBC News. 20. december 2020.
  33. ^ Chand, Meera; Hopkins, Susan; Dabrera, Gavin; Achison, Christina; Barclay, Wendy; Ferguson, Neil; Volz, Erik; Loman, Nick; Rambaut, Andrew; Barrett, Jeff (21. december 2020). Investigation of novel SARS-COV-2 variant: Variant of Concern 202012/01 (PDF) (Rapport). Public Health England. Hentet 23. december 2020.
  34. ^ "PHE investigating a novel strain of COVID-19". Public Health England. 14. december 2020.
  35. ^ Rambaut, Andrew; Loman, Nick; Pybus, Oliver; Barclay, Wendy; Barrett, Jeff; Carabelli, Alesandro; Connor, Tom; Peacock, Tom; L. Robertson, David; Vol, Erik (2020). Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations (Rapport). Written on behalf of COVID-19 Genomics Consortium UK. Hentet 20. december 2020.{{cite report}}: CS1-vedligeholdelse: Flere navne: authors list (link)
  36. ^ Kupferschmidt, Kai (20. december 2020). "Mutant coronavirus in the United Kingdom sets off alarms but its importance remains unclear". Science Mag (engelsk). Hentet 21. december 2020.
  37. ^ a b CDC. "Emerging SARS-CoV-2 Variants" (amerikansk engelsk). Centers for Disease Control and Prevention. Hentet 2021-01-04.
  38. ^ "New evidence on VUI-202012/01 and review of the public health risk assessment". khub.net. 15. december 2020.
  39. ^ "COG-UK Showcase Event - YouTube". YouTube. Hentet 2020-12-25.
  40. ^ Sandberg, Hallvard (1. jan. 2021). "Britiske forskere: Mutantviruset sprer seg raskere blant barna". NRK. Hentet 21. maj 2022.
  41. ^ "Coronavariant får Tyrkiet til at stoppe fly fra Danmark". Politiken. 20. december 2020. Hentet 21. maj 2022.
  42. ^ "Queensland travellers have hotel quarantine extended after Russian variant of coronavirus detected". www.abc.net.au (australsk engelsk). 3. marts 2021. Hentet 3. marts 2021.
  43. ^ Variants of concern or under investigation: data up to 3 March 2021 4 March 2021 www.gov.uk, accessed 5 March 2021
  44. ^ Latest update: New Variant Under Investigation designated in the UK 4 March 2021 www.gov.uk, accessed 5 March 2021
  45. ^ "South Africa announces a new coronavirus variant". The New York Times. 18. december 2020. Hentet 20. december 2020.
  46. ^ Wroughton, Lesley; Bearak, Max (18. december 2020). "South Africa coronavirus: Second wave fueled by new strain, teen 'rage festivals'". The Washington Post. Hentet 20. december 2020.
  47. ^ (18. december 2020). "Update on Covid-19 (18th December 2020)". Pressemeddelelse.  “Our clinicians have also warned us that things have changed and that younger, previously healthy people are now becoming very sick.”
  48. ^ Abdool Karim, Salim S. (19. december 2020). "The 2nd Covid-19 wave in South Africa:Transmissibility & a 501.V2 variant, 11th slide". www.scribd.com.
  49. ^ "Statement of the WHO Working Group on COVID-19 Animal Models (WHO-COM) about the UK and South African SARS-CoV-2 new variants" (PDF). World Health Organization. 2020-12-22. Hentet 2020-12-23.
  50. ^ a b Lowe, Derek (22. december 2020). "The New Mutations". In the Pipeline. American Association for the Advancement of Science. Arkiveret fra originalen 29. januar 2021. Hentet 23. december 2020. I should note here that there's another strain in South Africa that is bringing on similar concerns. This one has eight mutations in the Spike protein, with three of them (K417N, E484K and N501Y) that may have some functional role.
  51. ^ GISAID (21. december 2020). "Novel mutation combination in spike receptor binding site". Pressemeddelelse. Hentet 10. februar 2021. Arkiveret fra originalen den 22. februar 2021.
  52. ^ Mutert virus skaper uro blant eksperter i California (26. februar 2021)
  53. ^ Cedars Sinai Medical Center (18. januar 2021). "Local COVID-19 Strain Found in Over One-Third of Los Angeles Patients". Pressemeddelelse. Hentet 24. januar 2021. Arkiveret fra originalen den 31. januar 2021.
  54. ^ "New California Variant May Be Driving Virus Surge There, Study Suggests". New York Times. 19. januar 2021.
  55. ^ a b Emergence of a novel SARS-CoV-2 strain in Southern California, USA Wenjuan Zhang, Brian Davis, Stephanie S Chen, Jorge Sincuir Martinez, Jasmine T Plummer, Eric Vail 20 January 2021 doi.org/10.1101/2021.01.18.21249786 via www.medrxiv.org, Accessed 21 January 2021
  56. ^ BBC: Ny virusvariant i Storbritannia
  57. ^ "Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark" [Status of development of SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) in Denmark]. Statens Serum Institut. 16. februar 2021. Hentet 16. februar 2021.
  58. ^ "Varianten van het coronavirus SARS-CoV-2" [Variants of the coronavirus SARS-CoV-2] (nederlandsk). Rijksinstituut voor Volksgezondheid en Milieu, RIVM. 16. februar 2021. Hentet 16. februar 2021.
  59. ^ a b "B.1.525". Rambaut Group, University of Edinburgh. PANGO Lineages. 15. februar 2021. Hentet 16. februar 2021.
  60. ^ "A coronavirus variant with a mutation that 'likely helps it escape' antibodies is already in at least 11 countries, including the US". Business Insider. 16. februar 2021. Hentet 16. februar 2021.
  61. ^ "Variants of concern or under investigation: data up to 15 February 2021". Gov.uk. Public Health England. 16. februar 2021. Hentet 16. februar 2021.
  62. ^ a b c Roberts, Michelle (16. februar 2021). "Another new coronavirus variant seen in the UK". Health editor. BBC NEWS. Hentet 16. februar 2021.{{cite news}}: CS1-vedligeholdelse: url-status (link)
  63. ^ "What Scientists Know About the B.1.617 Coronavirus Variant". The Scientist. 2021. Hentet 21. maj 2022.
  64. ^ Futurity, Kathy Katella (2021). "What Is The Delta Variant? 5 Things You Need to Know". ScienceAlert. Arkiveret fra originalen 28. juli 2021. Hentet 21. maj 2022.
  65. ^ a b c d "Genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in Manaus: preliminary findings". Virological (engelsk). 2021-01-12. Hentet 2021-01-23.
  66. ^ "Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil". Japan Today. Japan. 11. januar 2021. Hentet 2021-01-14.
  67. ^ a b c ECDC (21. januar 2021). "Risk related to the spread of new SARS-CoV-2 variants of concern in the EU/EEA - first update" (PDF). European Centre for Disease Prevention and Control. Hentet 2021-02-02.{{cite web}}: CS1-vedligeholdelse: url-status (link)
  68. ^ Gallagher, James (22. januar 2021). "Coronavirus: UK variant 'may be more deadly'". BBC News. Hentet 22. januar 2021.
  69. ^ Chand et al., "Potential impact of spike variant N501Y" (p. 6).
  70. ^ a b KupferschmidtJan. 15, Kai; 2021; Pm, 4:55 (2021-01-15). "New coronavirus variants could cause more reinfections, require updated vaccines". Science | AAAS (engelsk). Hentet 2021-02-02.{{cite web}}: CS1-vedligeholdelse: Numeriske navne: authors list (link)
  71. ^ "Coronavirus variants and mutations: The science explained". BBC News (britisk engelsk). 2021-01-06. Hentet 2021-02-02.
  72. ^ a b c NIID (National Institute of Infectious Diseases) (12. januar 2021). "Brief report: New Variant Strain of SARS-CoV-2 Identified in Travelers from Brazil". Pressemeddelelse.
  73. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet ImmuneEscape
  74. ^ Detection of the recurrent substitution Q677H in the spike protein of SARS-CoV-2 in cases descended from the lineage B.1.429 - nCoV-2019 Genomic Epidemiology - Virological
  75. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet :7
  76. ^ a b c Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet US
  77. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet B.1.429
  78. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet :8
  79. ^ Voloch, Carolina M.; et al. (2020). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil" full text (see figure 5). Retrieved 15 January 2021. – via medRxiv.
  80. ^ Lovett, Samuel (14. januar 2021). "What we know about the new Brazilian coronavirus variant". The Independent. London. Hentet 2021-01-14.
  81. ^ Study Identifies Seven New Covid-19 Variants in U.S. Carrying ‘677’ Mutation
  82. ^ Study finds 7 COVID-19 variants originating in U.S. with the same mutation
  83. ^ Robin + Yellowhammer + Bluebird + Quail + Pelican + Mockingbird = New US Covid Variants could be more infectious – Magnetic Media
  84. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet :9
  85. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet Q677P
  86. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet :10
  87. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet B1.1.7, “Cluster B117”
  88. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet :11
  89. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet B1.526
  90. ^ "Covid: WHO renames UK and other variants with Greek letters". BBC (engelsk). 1. juni 2021. Arkiveret fra originalen 31. maj 2021. Hentet 1. juni 2021.
  91. ^ Bette Korber; Will M Fischer; Sandrasegaram Gnanakaran; Hyejin Yoon; James Theiler; Werner Abfalterer; Nicolas W Hengartner; Elena E Giorgi; Tanmoy Bhattacharya; Brian Foley; Kathryn M Hastie; Matthew D Parker; David G Partridge; Cariad M Evans; Timothy M Freeman; Thushan I de Silva; Sheffield COVID-19 Genomics Group; Charlene McDanal; Lautaro G Perez; Haili Tang; Alex Moon-Walker; Sean P Whelan; Celia C LaBranche; Erica Ollmann Saphire; David C Montefiori (3. juli 2020), "Tracking changes in SARS-CoV-2 Spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 virus", Cell, doi:10.1016/J.CELL.2020.06.043, PMC 7332439, PMID 32697968, Wikidata Q96870819
  92. ^ Voloch, Carolina M.; F, Ronaldo da Silva; Almeida, Luiz G. P. de; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana; Costa, Raissa Mirella da; Ferreira, Orlando C.; Workgroup, Covid19-UFRJ (2020-12-26). "Genomic characterization of a novel SARS-CoV-2 lineage from Rio de Janeiro, Brazil". medRxiv (engelsk): 2020.12.23.20248598. doi:10.1101/2020.12.23.20248598. ISSN 2024-8598.
  93. ^ Michael Greenwood (15 January 2021). "What Mutations of SARS-CoV-2 are Causing Concern?". News Medical. Retrieved 16 January 2021.
  94. ^ "Two new variants of coronavirus found in England under investigation". 9. februar 2021. Hentet 21. maj 2022 – via www.reuters.com.
  95. ^ COG-UK update on SARS-CoV-2 Spike mutations of special interest: Report 1 (PDF) (Rapport). COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK). 20. december 2020. s. 7. Arkiveret fra originalen (PDF) 25. december 2020. Hentet 24. januar 2021. {{cite report}}: Mere end en |archivedate= og |archive-date= angivet (hjælp); Mere end en |archiveurl= og |archive-url= angivet (hjælp); Mere end en |deadurl= og |url-status= angivet (hjælp); Ukendt parameter |deadurl= ignoreret (|url-status= foreslået) (hjælp)
  96. ^ Researchers Discover New Variant of COVID-19 Virus in Columbus, Ohio 13 January 2021, wexnermedical.osu.edu, accessed 16 January 2021
  97. ^ Distinct Patterns of Emergence of SARS-CoV-2 Spike Variants including N501Y in Clinical Samples in Columbus Ohio Huolin Tu, et al. 15 January 2021 via www.biorxiv.org, accessed 16 January 2021, doi.org/10.1101/2021.01.12.426407
  98. ^ "University of Graz". www.uni-graz.at. Arkiveret fra originalen 6. maj 2021. Hentet 2021-02-22.
  99. ^ "Coronavirus SARS-CoV-2 (formerly known as Wuhan coronavirus and 2019-nCoV) - what we can find out on a structural bioinformatics level". Innophore (amerikansk engelsk). 2020-01-23. Hentet 2021-02-22.
  100. ^ Singh, Amit; Steinkellner, Georg; Köchl, Katharina; Gruber, Karl; Gruber, Christian C. (2021-02-22). "Serine 477 plays a crucial role in the interaction of the SARS-CoV-2 spike protein with the human receptor ACE2". Scientific Reports (engelsk). 11 (1): 4320. doi:10.1038/s41598-021-83761-5. ISSN 2045-2322.
  101. ^ "BioNTech: We aspire to individualize cancer medicine". BioNTech (engelsk). Hentet 2021-02-22.
  102. ^ Schrörs, Barbara; Gudimella, Ranganath; Bukur, Thomas; Rösler, Thomas; Löwer, Martin; Sahin, Ugur (2021-02-04). "Large-scale analysis of SARS-CoV-2 spike-glycoprotein mutants demonstrates the need for continuous screening of virus isolates". bioRxiv (engelsk): 2021.02.04.429765. doi:10.1101/2021.02.04.429765.
  103. ^ "Study shows P681H mutation is becoming globally prevalent among SARS-CoV-2 sequences". News-Medical.net (engelsk). 10. januar 2021. Hentet 11. februar 2021.
  104. ^ Maison, David P.; Ching, Lauren L.; Shikuma, Cecilia M.; Nerurkar, Vivek R. (7. januar 2021). "Genetic Characteristics and Phylogeny of 969-bp S Gene Sequence of SARS-CoV-2 from Hawaii Reveals the Worldwide Emerging P681H Mutation". bioRxiv : The Preprint Server for Biology (engelsk): 2021.01.06.425497. doi:10.1101/2021.01.06.425497. PMC 7805472. PMID 33442699. Hentet 11. februar 2021. Available under CC BY 4.0.
  105. ^ This table is an adaptation and expansion of Alm et al., figure 1.
  106. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet Rambaut et al.
  107. ^ a b c Bedford, Trevor; Hodcroft, Emma B; Neher, Richard A (6. januar 2021). "Updated Nextstrain SARS-CoV-2 clade naming strategy". nextstrain.org/blog. Hentet 19. januar 2021.
  108. ^ Fodnotefejl: Ugyldigt <ref>-tag; ingen tekst er angivet for referencer med navnet Zhukova
  109. ^ PANGO lineages-Lineage B.1.1.28 cov-lineages.org, accessed 4 February 2021
  110. ^ "clade tree (from 'Clade and lineage nomenclature')". www.gisaid.org. 4. juli 2020. Hentet 7. januar 2021.

Eksterne henvisninger


Fodnotefejl: <ref>-tags eksisterer for en gruppe betegnet "lower-alpha", men der blev ikke fundet et tilsvarende {{reflist|group="lower-alpha"}}, eller et afsluttende </ref>-tag mangler

Medier brugt på denne side

Gnome globe current event.svg
Forfatter/Opretter: David Vignoni (globe, clock face/ring), Anomie (clock hands), David Göthberg (making the clock red, shadows). Anomie and David G (putting all the parts together)., Licens: LGPL
Globe with clock to represent a "current event"
Clockimportant.svg
Forfatter/Opretter:

The original uploader was Yzmo at engelsk Wikipedia.

Later versions were uploaded by Tene at en.wikipedia., Licens: LGPL
This image is combined from the following two images.
Flag of South Africa.svg

Sydafrikas flag

Used color: National flag | South African Government and Pantone Color Picker

     grøn rendered as RGB 000 119 073Pantone 3415 C
     gul rendered as RGB 255 184 028Pantone 1235 C
     rød rendered as RGB 224 060 049Pantone 179 C
     blå rendered as RGB 000 020 137Pantone Reflex Blue C
     hvid rendered as RGB 255 255 255
     sort rendered as RGB 000 000 000
SARS-CoV-2 genome.svg
Forfatter/Opretter: Furfur, Licens: CC BY-SA 4.0
SARS-CoV-2 genome organisation (isolate Wuhan-Hu-1, GenBank Acc MN908947).
ORF1a polyprotein;ORF1ab polyprotein (largest gene), S surface glycoprotein (structural protein, spike protein), ORF3a (viral accessory) - NCBI Gene ID: 43740569, M, ORF6, ORF7, ORF8, ORF10.
SARS-CoV-2 without background.png
This illustration, created at the Centers for Disease Control and Prevention (CDC), reveals ultrastructural morphology exhibited by coronaviruses. Note the spikes that adorn the outer surface of the virus, which impart the look of a corona surrounding the virion, when viewed electron microscopically. A novel coronavirus, named Severe Acute Respiratory Syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2), was identified as the cause of an outbreak of respiratory illness first detected in Wuhan, China in 2019. The illness caused by this virus has been named coronavirus disease 2019 (COVID-19).
CC-BY icon.svg
Creative Commons "Attribution" license icon.